吴君柔乃镇上出名的灵媒，但其实她只是“挂羊头卖狗肉”，为救因杀人被判死刑的大哥吴军瑜。适逢世纶甫到埗曾误会君柔是一件离奇剑鱼杀人案中的疑凶，几乎害她被杀头，君柔便利用世纶对自己内疚怜惜之心，加上月娥急于为世纶续弦以继后香灯，君柔就施计嫁入施家，希望借世纶为大哥翻案。不料大婚当日，君柔发现世纶竟是当日幕后代判大哥死刑的始作俑者！丈夫变仇人，君柔决定当“卧底老婆”向世纶报复，要令他失去官职、要令施家家变！世纶渐发觉一切风风雨雨皆由君柔而生，终知道她是为报复而嫁入施家，但世纶坚持没有错判，加上世纶又在月娥安排下娶了另一位妻子小蝶，世纶与君柔遂变成冤家，明争明斗起来。
《施公奇案Ⅱ》作为TVB典型的续作，在延续前作风格的同时，也暴露出港剧刑侦题材创作力衰退的困境。欧阳震华饰演的施世纶依旧保持着“憨直智者”的形象，其松弛自然的表演风格成为全剧少有的亮点。但剧本对角色塑造的乏力显而易见，新加入的两位妻子吴君柔与陆小蝶，人物关系发展仓促潦草，宣萱的角色本应是情感核心，却因缺乏铺垫沦为功能性人物。
剧情架构上，该剧试图复制前作“灵异+推理”的模式，但破案关键过度依赖枕仙提示，使得悬念设计形同虚设。观众早已知晓答案，只能被动观看主角们“刻意”绕远路的侦查过程，这种叙事逻辑削弱了刑侦剧应有的智力对抗魅力。案件编排也显疲态，海盗宝藏、身世谜云等桥段充斥着廉价的戏剧冲突，远不如《刑事侦缉档案》系列中人性挣扎的刻画深刻。
主题表达方面，剧中反复强调的“家庭和睦”观念虽契合传统价值观，却因情感线处理粗糙而显得说教味浓重。相比之下，《洗冤录》通过职业成长自然带出家国情怀的叙事策略显然更高明。更可惜的是唐宁饰演的陆小蝶暗藏第三部伏笔，却因结局仓促未能展开，反而坐实现有故事鸡肋化的批评。
总体而言，这部续作如同港产类型剧的缩影：老戏骨演技在线却难掩剧本硬伤，套路化创作透支着观众信任。当刑侦剧沦为流水线产品时，即便有欧阳震华这样的演员撑场，也终究难以重现经典系列的辉煌。